В результате использования генной инженерии для создания новых видов растений и животных вполне возможна вероятность возникновения новых опасных вирусов, которые ничего не будут бояться. Уже сейчас экспериментальным путём было доказано, что встроенные гены вирусов способны соединяться с генами инфекционных вирусов. Также учёными отмечено, что новые вирусы вполне могут оказаться гораздо опаснее и коварнее уже существующих вирусов. Кроме этого, новые вирусы могут стать менее видоспецифичными. К примеру, новые вирусы растений вполне могут стать опасными для людей или полезных насекомых.
Кроме всего прочего, на сегодняшний день наука ещё не до конца изучила всё о ДНК. Всего на данный момент человечеству известно о функции 3% ДНК. Поэтому производить какие бы то ни было манипуляции с сложными системами -это весьма рискованное дело. Результаты проводимых исследований в области экологии, биологии и медицины, говорят о том, что такое вмешательство может оказаться непредсказуемыми или даже плачевными.
Уже сегодня учёные высказывают предположение о том, что генная инженерии не может стать панацеей в деле решения проблемы голода на планете. То есть с помощью генной инженерии этот сложный во всех отношениях вопрос решить не удастся.